На этом съезде обсуждался широчайший круг вопросов, затрагивающих эпидемиологию, диагностику и терапию наследственных болезней, генетику многофакторных болезней, фармакогенетику, мутагенез, генотоксикологию и т.д. Из этого становится понятно, что на сегодняшний день генетика является настолько быстроразвивающейся, что даже специалисту бывает трудно отследить все новинки. Однако я попытаюсь обобщить и изложить для вас усвоенную информацию.
После триумфальной расшифровки генома человека и вступления в геномную эру, медицина получила новый вектор развития - «Медицина 4П», т.е. профилактическая, персонифицированная, прогностическая и партнерская. Актуальной задачей такой медицины является разработка и внедрение методов ранней диагностики патологических состояний и поиск способов их терапии с учетом индивидуальных биологических особенностей конкретного человека. Все это требует развития таких направлений, как индивидуальная и популяционная геномика, протеомика, транскриптомика, генная инженерия и т.д. Для решения этих задач необходимо как наличие национальных биобанков, содержащих большую выборку индивидуальных документированных проб, так и наличия точно и эффективно работающих инструментов для изучения функций генов и их взаимодействия. Необходимость создания сети биобанков в России созрела давно (многие развитые страны, такие как Великобритания, Канада, Австрия и другие, такие банки имеют) и сейчас ведется большая работа по систематизации анкетной и медицинской информации о биообразцах и правилах их длительного хранения. В настоящее время работу в этом направлении ведут Санкт-Петербургский Государственный университет совместно с «НИИАГиР им. Д.О. Отта», Институт Общей генетики им. Н.И. Вавилова, Медико-генетический научный центр, Институт гуманитарных исследований республики Башкортостан и многие другие.
Какие новые инструменты для изучения генов появились?
Во-первых, это ПЦР (PCR) третьего поколения - цифровая ПЦР, особенности методики которой позволяют отследить 1 редкую копию ДНК на фоне 100 000 копий геномной ДНК. Т.е это очень высокочувствительный метод.
Зачем это нужно? Вот один из примеров:
Понимание молекулярных механизмов онкогенеза (развития опухолей) привело к прорыву в лечении больных с гемобластозами ("рак крови"
и многими другими онкологическими заболеваниями. Появились препараты таргетной (прицельной) терапии, которые действуют непосредственно на клетки опухоли. Применение таких препаратов привело к появлению большой группы больных со стойкой ремиссией заболевания. В такой ситуации оценка эффективности терапии и глубины ремиссии имеет принципиальное значение. Традиционно, для этих целей используют ПЦР в реальном времени-Real Time PCR. Но метод имеет ряд технических ограничений. А цифровая PCR эти ограничения преодолевает. Т.о. внедрение данного метода позволяет как подтвердить стойкую ремиссию так и отследить ранний рецидив, а значит, быстрее и успешнее с ним справиться. Такая молекулярно подтвержденная глубокая и стойкая ремиссия является главным условием отмены терапии при некоторых гемобластозах. После отмены терапии контроль должен быть еще более пристальный, чтобы не пропустить возможный рецидив. Таким образом выделяется группа пациентов с длительной ремиссией без терапии. И вот тут наступает черед других новейших инструментов изучения генома, таких как полногеномный сиквенс нового поколения, Next Generation Sequensing (NGS) technology. С помощью этой методики ведется как поиск новых мутаций в уже известных генах, (в случае с гемобластозами, это поиск driver-мутаций, т.е. «двигающих» лейкоз), так и выявление новых генов-кандидатов, ответственных за появление того или иного генетического заболевания, а так же ведется масштабная работа по изучению генных сетей различных болезней.Новые методы появились и в цитогенетике - это хромосомный микроматричный анализ, который позволяет выявлять мелкие, не видимые глазом хромосомные перестройки. Однако, (и мне, как цитогенетику, очень отрадно это осознавать), старая, добрая, классическая цитогенетика тоже не потеряла своей актуальности. Во многих докладах подчеркивалось, что окончательный диагноз у пациентов с аномалиями фенотипа может быть установлен только при комбинации различных методов и GTG-окрашивание хромосом остается на сегодняшний день «золотым стандартом». Так же, на мой взгляд, впервые столь масштабно, был затронут вопрос о гоносомном мозаицизме. Этот вопрос обострился в связи с быстрым развитием вспомогательных репродуктивных технологий и методов пренатальной диагностики. Т.о., перед медицинскими генетиками сейчас остро стоит вопрос о разработке алгоритмов диагностики наследственной патологии, включающих современные методы исследований и способы интерпретации результатов.
Так же не могу не отметить, что анализ уже накопленных с помощью новых технологий знаний, привел к пополнению традиционной классификации наследственных болезней. Появились генетически детерминированные заболевания, имеющие определенную специфику типов мутаций, механизмов их возникновения и наследования в ряду поколений и в ходе онтогенеза, имеющих особенности клинического проявления, часто отклоняющиеся от менделеевского наследования. Это заболевания, связанные с нарушением архитектуры генома. Понимание природы заболеваний, в свою очередь, привело к началу работ по выработке методов терапии с помощью генной инженерии. В первую очередь это работы по перепрограммированию плюрипотентных стволовых клеток человека и создание клеточных систем, моделирующих различные заболевания. Например, Научный центр неврологии совместно с Институтом молекулярной генетика РАН, ведут такие исследования по трем тяжелейшим нейродегенеративным заболеваниям: болезни Паркинсона, хореи Гентингтона и боковому амиотрофическому склерозу (им болеет Стивен Хокинг). Все это вместе дает нам надежду, что диагноз наследственной болезни не будет звучать как приговор и люди, имеющие такую патологию, смогут вести полноценную жизнь и быть счастливыми!
Как вы понимаете, конференцию, которая длилась 4 дня, трудно уложить в несколько страниц. Я просто попыталась обобщить главное из услышанного. Опять же, это мое восприятие информации. Что бы вы могли составить свое мнение, читайте журнал «Медицинская генетика» № 2, 3, 4 за 2015, там опубликованы тезисы докладов.
Для написания данного отчета мной были использованы следующие тезисы:
- New generation sequansing in clinical practice at the Children*s hospital of Philadelphia. Bakay M at all.
- Геногеография-медицине. Балановский ОП
- Мультифакторные заболевания и системная генетика. Баранов ВС
- Особенности создания биобанка ДНК малых популяций. Богунов ЮВ и др.
- Опыт применения технологий высокопроизводительного сиквенирования для диагностики наследственных заболеваний сердца в российской выборке. Букаева АА и др.
- Перспективы биобанкирования в репродуктивной генетике. Глотов АС и др.
- Геногеографические биобанки на службе у персонализированной медицины. Жабагин МК и др.
- Технология полногеномного секвенирования в диагностике моногенных заболеваний. Жукова ЕА и др.
- Новые методы диагностики наследственной патологии: проблемы и перспективы. Канивец ИВ и др.
- Архитектура генома и хромосомные болезни. Лебедев ИН и др.
- Возможности использования стандартного метода ПЦР в режиме реального времени и автоматизированного анализатора GeneXpert Dx System в определении глубокого молекулярного ответа у больных ХМЛ. Мартынкевич ИС и др.
- Новые методы геномной инженерии в биомедицинских исследованиях. Медведев СП и др.
- Цитогенетический контроль индуцированных плюрипотентных стволовых клеток в экспериментальных исследованиях болезни Паркинсона. Симонова ВВ и др.
- Возможности и перспективы сравнительной геномной гибридизации на микрочипах в клинической цитогенетике и репродуктивной медицине. Скрябин НА и др.
- Молекулярно-генетические предикторы безопасной отмены таргетной терапии ХМЛ на основе полноэкзомного анализа. Смирнихина СА и др.
- Перспективы использования многофункциональных биобанков для исследований в проблемном поле генетики человека. Солопекин НВ и др.
- Оценка цитогенетического статуса человека. Диагностика, коррекция, профилактика цитогенетических нарушений. Сычева ЛП и др.
- Некоторые генетические аспекты нарушения половой аутоидентификации. Хаят СШ и др.
- Гоносомный мозаицизм и его роль в нарушении формирования пола и репродукции. Черных ВБ и др.
- Структура геномного дисбаланса у пациентов с аномалиями фенотипа и нормальным кариотипом при СЦИ. Шилова НВ и др.
- Региональный исследовательский биобанк: принципы формирования и перспективы использования. Юсупов ЮМ и др.
- Постановление VII съезда Российского общества медицинских генетиков (г. Санкт-Петербург, 19-23 мая 2015г.)
